O ICB possui em sua estrutura três Órgãos Complementares, criados pelo Conselho Universitário da UFMG, de acordo com o Art. 65 do Estatuto da Universidade, para colaborar no desenvolvimento do ensino, pesquisa e extensão do Instituto. Cada um desses órgãos possui diretoria e regimento interno aprovados pela Congregação da Unidade.
São Órgãos Complementares do ICB:
- Centro de Aquisição e Processamento de Imagens (CAPI)
- Centro de Bioterismo (CEBIO)
- Centro de Coleções Taxonômicas (CCT)